用户卡结构中主要存在以下两个密钥文件及相应的几个密钥：
MF下的密钥文件(简称KMF)，其装载的密钥是卡片主控密钥(简称CCK，以下同);
ADF下的密钥文件(简称KADF)，其装载的密钥有应用主控密钥(简称ACK，以下同),应用维护密钥(简称AMK)，及其它应用密钥;
其它密钥，如口令密钥PIN，口令解锁密钥，DES运算密钥等等。
卡片初始化功能
CPU卡的卡片初始化系统，实现CPU卡的密钥灌装和卡内结构初始化的工作。建立卡片文件结构、安装各工作密钥等卡片初始化工作。
PSAM卡的卡片初始化和发行工作，装载各类CPU卡工作密钥。
CPU卡门禁读卡器
CPU卡门禁读卡器将安全认证机制引入门禁控制领域。采用支持CPU卡并且支持PSAM卡(读卡器本身带SAM卡插槽)的门禁读卡器，应用PSAM卡安全认证读写机制，极大地提高了传统门禁读卡器的安全级别。
安全优势：
CPU卡安全门禁读卡器采用SAM(PSAM)与CPU卡的安全认证，建立了完整、严密的密钥管理系统，充分使用了CPU卡安全特性，包括CPU卡和SAM卡的密钥系统。密钥注入SAM卡后，外部无法读取。将SAM卡插入读卡设备内，通过SAM卡和CPU卡进行双向验证。验证报文是由随机因子参与计算的，同一张卡在一台设备上刷卡，每次都不相同，彻底杜绝“伪卡”的出现。
在门禁读卡器中安装SAM卡座，所有的认证都是由安装在SAM卡座中的SAM卡进行运算的。PSAM卡一般支持标准DES和3DES算法，并可以根据密钥长度自动选择算法，具有明文加MAC、密文、密文加MAC三种方式的数据和密钥线路保护功能。
CPU卡
与非接触逻辑加密卡系统相比， 非接触式 CPU卡在现有的技术条件下是不可伪造的;
CPU卡是真正意义上的智能卡，就是人们常说的SmartCard。卡内集成包括中央处理器(CPU)、只读存储器(ROM)、随机存取存储器(RAM)、电可擦除可编程只读存储器(EEPROM)等主要部分，具有卡内操作系统COS (Chip Operating System)，用COS实现对卡内数据的保护，如用户和系统的相互认证、应用顺序控制和管理、随机数的产生和传输、密钥管理、加密、解密、信息的安全传输等。犹如一台超小型电脑。具有信息量大、防伪安全性高、可脱机作业，可多功能开发等优点。
非接触CPU卡智能卡与非接触逻辑加密卡相比，拥有独立的CPU处理器和芯片操作系统，所以可以更灵活的支持各种不同的应用需求，更安全的设计交易流程。非接触式CPU卡具有三种认证方式，持卡者合法性认证——PIN校验，卡合法性认证——内部认证，系统合法性认证——外部认证，对交易的各个单元(持卡人、卡片、终端设备)进行相互认证，保证交易介质的合法性;在以上认证过程中，密钥是不在线路上以明文出现的，它每次的送出都是经过随机数加密的，而且因为有随机数的参加，确保每次传输的内容不同，保证了交易内容的合法性。所以，采用非接触式CPU卡可以杜绝伪造卡、伪造终端、伪造交易，最终保证了交易的安全性。
